Tres grandes corredores ambientales son ejes fundamentales para el ecosistema de la región. El corredor de la cordillera Central, que incluye el PNN Los Nevados; el corredor de la cordillera Occidental, que incluye el PNN Tatamá y el Parque Regional Natural Cuchillas de San Juan; y el corredor ambiental de los ríos Cauca y el Risaralda, de gran importancia para el asentamiento de la población y cultivo, dadas las condiciones de fertilidad de los suelos.
El 44% del departamento tiene una cobertura de bosque natural y/o secundario de tipo andino, subandino, altoandino y páramo. Cerca del 28% del territorio corresponde a cultivos semipermanentes o permanentes; el 22% a pastos; el 4% a vegetación natural arbustiva; y el 2% restante no posee cobertura vegetal, ya que son suelos urbanizados.
Risaralda también es lugar de hábitat de pumas, osos de anteojos, dantas de páramo, venados, armadillos y una gran cantidad de especies de reptiles, anfibios y aves endémicas y migratorias, que viven en las áreas de reserva y conservación.
El 32% del territorio risaraldense está bajo alguna figura de protección. Ello se representa en 3 parques nacionales naturales, 5 parques regionales naturales, 11 parques municipales naturales y 2 áreas de manejo especial étnico.
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Este parque conserva un paisaje rico en especies animales y vegetales, hasta el momento se han registrado cerca de 500 especies de aves, 150 de mamíferos y tres de las cuatro especies de mamíferos acuáticos, los peces también son numerosos y proveen de alimentación a los habitantes de la región. El parque Amaracayu alberga al delfín rosado del Amazonas, especie única en el mundo y de gran belleza, además 293.500 hectáreas de paisaje selvático plano de la cuenca sedimentaria del río Amazonas, en plena selva se han construido 4 plataformas para la observación de la flora y fauna. A 60 kilómetros de Leticia, remontando el río amazonas, se llega en predios del parque al centro de visitantes Yawaé, que significa Señor de los Bosques en lengua Tikuna. Tiene capacidad para hospedar 50 personas y cuenta con todos los servicios, incluyendo energía eléctrica entre 6 y 10 de la noche, un salón múltiple con capacidad para 36 personas, museo etnográfico, centro de documentación, laboratorios, albergues, muelle, cafetería y restaurante.
